用微生物来出产化合物为化学工业供给了一种可继续和环保的办法。可是,辨认和开发合适的细胞系是把生物引进出产过程的瓶颈,由于有着极高的时刻和人力本钱。体系生物学所拿手的全基因剖析和数学模型可以被使用到生物处理上来,然后驱动代谢工程里惯用的规划,构建,测验和学习的循环结构 (Design-Build-Test-Learn, DBTL)的使用和加快细胞工厂的规划。可是为每一个化合物量身订造一个DBTL结构仍是一个高本钱低功率的战略。
所以,曼彻斯特大学的精密化合物和特种化合物组成生物中心的Nigel S. Scrutton的团队在这里规划和开展了一个简化主动化、归纳的、适用于一切化合物,并且无需知道之前有否成功的战略的DBTL结构。作者们用计算取样的办法考虑了少量的规划参数,很多的途径里的变数,再加上主动的实验程序,就可以成功 地把结构的原型快速地制造出来。他们用这个办法来改进类黄酮被大肠杆菌出产的产值,考虑了出产类黄酮的分子途径里四个重要的酶,和每个酶的四个重要的参数和相关的变数,一共两千多个或许的组态。仅用了两个DBTL的周期,他们就把或许的组态的数目大规模地缩小,然后实验,最终把类黄酮的产值增加到本来的程序所能到达的500 倍。